一、股东不在工商备案是否有效
只在公司内部有效，且不能对抗善意第三人。
入股时需要在工商局备案及写入公司章程，将公司的章程到公司登记注册地的工商局留存备份，公司设立、变更都会引起章程内容的变化。
因此都需要向工商局重新提交一份新的章程或者章程修正案，章程上需有股东的签字(自然人)或盖章(法人)章程内容变更后，如果未办理备案，则新的章程只在公司内部有效，不能对抗善意第三人。
《中华人民共和国公司法》
第二十八条 【出资义务】股东应当按期足额缴纳公司章程中规定的各自所认缴的出资额。股东以货币出资的，应当将货币出资足额存入有限责任公司在银行开设的账户;以非货币财产出资的，应当依法办理其财产权的转移手续。
股东不按照前款规定缴纳出资的，除应当向公司足额缴纳外，还应当向已按期足额缴纳出资的股东承担违约责任。
第二十九条 【设立登记】股东认足公司章程规定的出资后，由全体股东指定的代表或者共同委托的代理人向公司登记机关报送公司登记申请书、公司章程等文件，申请设立登记。
二、入股注意事项
如果想以股东的身份加入，必须修改公司章程，修改后的章程还要到工商机关备案。
要清楚是合伙还是公司，如果是公司，仅仅是股权装让。如果是合伙，还得加入之前该合伙的债务承担无限连带责任。聘请法律顾问全面介入，保护利益的最大化
从上文当中我们可以看出来，股东如果不在工商备案，就只在公司内部有效，并且不能对抗善意第三人，所以如果想以股东的身份入股，那么就必须修改公司章程，然后积极去工商局备案，如果需要法律方面的帮助，读者可以到华律网进行咨询，华律网有专业的律师为你解答。
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