答：《财政部、国家税务总局关于股权转让有关营业税问题的通知》(财税[2002]191号)第二条规定："对股权转让不征收营业税。"因此，B公司将其拥有的Y公司的所有股权转让给A公司不缴纳营业税，但涉及所得税，《国家税务总局关于企业股权投资业务若干所得税问题的通知》(国税发[2000]118号)第二条规定："企业股权投资转让所得和损失的所得税处理：
(一)企业股权投资转让所得或损失是指企业因收回、转让或清算处置股权投资的收入减除股权投资成本后的余额。企业股权投资转让所得应并入企业的应纳税所得，依法缴纳企业所得税。
被投资企业对投资方的分配支付额，如果超过被投资企业的累计未分配利润和累计盈余公积金而低于投资方的投资成本的，视为投资回收，应冲减投资成本;超过投资成本的部分，视为投资方企业的股权转让所得，应并入企业的应纳税所得，依法缴纳企业所得税。
(二)被投资企业发生的经营亏损，由被投资企业按规定结转弥补;投资方企业不得调整减低其投资成本，也不得确认投资损失。
(三)企业因收回、转让或清算处置股权投资而发生的股权投资损失，可以在税前扣除，但每一纳税年度扣除的股权投资损失，不得超过当年实现的股权投资收益和投资转让所得，超过部分可无限期向以后纳税年度结转扣除。"
因此，B公司转让股权应按上述规定进行所得税处理。上述股权转让行为中A公司和Y公司不涉税。
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