该协议是否为无效协议

93年我市进行城市拆迁，我家祖房位于拆迁范围内，拆迁采用一次性对原产权进行补偿，并优先购买新建房的方式进行。当时祖房产权为母亲及其六名子女共有。拆迁协议及补偿款由母亲签订并领取。后按政策和本户拆迁面积我家可购买平价铺面一套、平价住房一套及部分商品价住房一套。当时小儿子首先自费购买了平价住房，母亲用补偿款及自己的钱购买了含部分商品价的另一套住房，大儿子在无人购买的情况自费购买了铺面并从1995年开始出租。98年母亲进行了公证，说明铺面为大儿子购买，产权归大儿子所有。但2007年大儿子病危住院期间，母亲和其余五名子女到大儿子家吵闹，说铺面为共有财产，要求对铺面及租金进行处理。社区组织母亲、大儿媳及其余五名子女进行了调解，要求大儿子拿出50万对其余六人进行补偿。因丈夫已处于病危状况，为避免他们骚扰，大儿媳不得已在协议上签了字（大儿子未签）。后该协议未履行，社区也未在协议上盖调解公章。三个月后大儿子病逝。一审时该协议被认定未无效协议，不予支持，铺面产权判归大儿子家所有，二审时产权也判归大儿子家，但要求按该协议拿出50万对其余六人进行补偿。请问该协议既然未盖公章是否可以认定为无效协议，因为该协议并不是大儿子真实意思的体现，二审时按该协议进行补偿是否合理、合法？多谢！