公司以发现金的方式发工资，在工资额超过个人所得税起征线的情况下，也是要扣个人所得税的。只要是工资所得，符合纳税标准的都需要缴纳个人所得税。根据《中华人民共和国个人所得税法》
第二条下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：
（一）工资、薪金所得；
（二）劳务报酬所得；
（三）稿酬所得；
（四）特许权使用费所得；
（五）经营所得；
（六）利息、股息、红利所得；
（七）财产租赁所得；
（八）财产转让所得；
（九）偶然所得。居民个人取得前款
第一项至
第四项所得（以下称综合所得），按纳税年度合并计算个人所得税；非居民个人取得前款
第一项至
第四项所得，按月或者按次分项计算个人所得税。纳税人取得前款
第五项至
第九项所得，依照本法规定分别计算个人所得税。
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