女方的嫁妆通过双方的书面协议证明为女方个人的婚前财产的，那么这份协议是否有效若想让协议生效必须要经过公证吗？

协议有效。
1.婚前，父母为子女出资购房的一般看做是对自己子女个人的赠与，但明确表示对夫妻双方赠与的除外。现在房产如果登记的还是你父亲的名字，那房子还是你父亲的财产，并未发生改变。即使说好是陪嫁的，但是没有明确表示是对双方赠与的话，不可能会成为夫妻共同财产的。因为没办理过户，这个情况下只能是你父亲的个人财产。如果你们有书面协议或证明的话，就是有了赠与合同，还未发生物权的转移，只是有了债权关系。
2.父母将房产无偿赠与未成年子女的应按如下手续办理：（1）到公证处办理房产所有人“赠与公证书”和受赠人“接受赠与公证书”或双方共同办理的“赠与合同公证书”以及赠与人和受赠人亲属关系的公证书。鉴于受赠人系未成年人，建议办理单方法律行为公证，即办理房产所有人“赠与公证书”和受赠人“接受赠与公证书”，当然由于各地执行情况不一，最好事先到房管部门询问清楚，按房管部门规定的要求办理为妥。（2）持办理的公证书、当事人有效的身份证件、房产所有证到房管部门申请办理过户手续；（3）按房管部门要求到税收部门缴纳税收，填写《个人无偿赠与不动产登记表》，经税务部门审核后，可以免交营业税（5%）、个人所得税（20%）、城市维护建设税及教育费附加（7%）。契税（3%-5%之间）、万分之五的印花税、评估费、登记费不予减免。（4）持有加盖“个人无偿赠与”印章契税完税凭证到房管部门办理赠与产权转移登记手续。