合同说房产证在初始登记180天后办理，但是没明确初始登记时间，该怎么算

那就合同在约定了。

房产证的办理时间：
首先要依据商品房买卖合同的约定，如果在商品房买卖合同中对办理房产证版的期限作了约定，开发商就应当在合同约定的期限内协助买受人办理房屋的产权证，否则就要承担违约责任。
其次，如果合同中没有对办理产权证的期限作出约定，就适用法律规定的期限。那就是人们常提到的所谓的“90”天的期限。一个“90”天是指，商品房买卖合同的标的物权为尚未建成房屋的，自房屋交付使用之日起90日；一个“90 天是指，商品房买卖合同的标的物为已竣工房屋的，自合同订立之日起90日。
根据我国相关法律规定，交房入住90天内房产证必须办理成功，否则视为违约。可以向开发商寻求赔偿或协商解决方式。
如果购房合同上写明了一个房产证办理时间，那么你一旦签字后，便以合同上的时间为准，在合同规定时间内办理好都不算违约。只有超过合同上的约定时间，还未办好，那么你可以按照合同上规定的赔偿方式向开发商索要赔偿。
《最高人民法院关于审理商品房买卖合同纠纷案件适用法律若干问题的解释》
第十八条由于出卖人的原因，买受人在下列期限届满未能取得房屋权属证书的，除当事人有特殊约定外，出卖人应当承担违约责任：
(一)商品房买卖合同约定的办理房屋所有权登记的期限
(二)商品房买卖合同的标的物为尚未建成房屋的，自房屋交付使用之日起90日
(三)商品房买卖合同的标的物为已竣工房屋的，自合同订立之日起90日。
合同没有约定违约金或者损失数额难以确定的，可以按照已付购房款总额，参照中国人民银行规定的金融机构计收逾期贷款利息的标准计算。

咨询主管部门即可

180天以后进行催告，催告的合理期限内还不办理构成违约。