不会
C1驾驶证在实习中扣3分是没有关系的，只要今后注意，不要再发生违章记分了，而且及时把罚款交了就没事了，到实习期结束时就会自动转为正式驾驶证的，如果累积到12分就要注销驾驶证了，所以以后一定要注意不再违章记分了。
C1驾驶证在实习期内不满12分就没事的。
机动车驾驶人在实习期内有记满12分记录的，注销其实习的准驾车型驾驶资格。被注销的驾驶资格不属于最高准驾车型的，还应当按照第六十八条第一款规定，注销其最高准驾车型驾驶资格。
持有大型客车、牵引车、城市公交车、中型客车、大型货车驾驶证的驾驶人在一年实习期内记6分以上但未达到12分的，实习期限延长一年。在延长的实习期内再次记6分以上但未达到12分的，注销其实习的准驾车型驾驶资格。
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