按照所提问题，出现三个主体，假设两个公司分别为A和B，一个项目为甲。
出现二个可能：
可能一、“分红的时候怎么开发票”，表明是A、B共同参与一项目，根据A、B参与业务情况，A、B与甲订立三方协议。这时候的发票由A、B分别开给甲，不存在“分红”。也可以在A、B中商定一方，假定A与甲订立协议，A、B之间再订立合同。就象总包和分包关系，这时候的发票程序为：A给甲，B给A，至于B给A的发票金额，就包含“分红”的金额，要A、B事先尚定好。
可能二、“经营最后的利润分给另外一个公司”，表明是A、B合资成立公司（以下简称乙），应该签订合伙或合资的合同。经营最后的利润就是税后利润，税后利润不开发票，只开收据。至于分配的形式是转帐还是现金，法律、法规没有规定，事实上都可以。
做帐：
可能一，发票是作为收入成本处理的；
可能二，收据是作为利润分配处理的，不作收入成本。
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