土地问题

(一)土地承包经营权入股的正当性争议
《物权法》第128条规定“土地承包经营权人依照农村土地承包法的规定，有权将土地承包经营权采取转包、互换、转让等方式流转”。《农村土地承包法》第42条规定“承包方之间为发展农业经济, 可以自愿联合将土地承包经营权入股, 从事农业合作生产”。浙江、重庆、天津以及山东等地方政府根据国家法律法规纷纷出台暂行办法。广东省农业厅的专题调研表明“入股在广东省农村土地承包经营权流转中占最大比例, 流转面积为151万亩, 占流转总面积的35.9”。8吸取广东经验，福建、浙江纷纷试点，随后全国不同地方都开始不同程度的尝试。土地入股农业专业合作社在实践中逐步得到认可，但理论界对于入股这一土地承包经营权流转形式的正当性争议不减。支持者认为这不仅有利于增加对技术、资金入股的吸引力,有利于发展高产、优质、高效、绿色农业, 推动我国农业优质化迈进 有利于农业产业结构的调整与农业生产力的提高有利于把农民从土地上解放出来, 解决农民既想外出务工又不想抛弃土地的矛盾, 有利于增加农民收入。9反对者认为成立农民专业合作社的主要目的不是要农民用土地入股合作社实行集体生产，农业生产还必须应以家庭经营为基础。反对的深层次原因在于我国农村基本国情：人多地少，分布不均。社会保障功能被赋予在农村承包地上。
支持者和反对者都从不同的角度对土地承包经营权入股阐述了自己的立场，支持者看到了入股所带来的红利：农业生产规模效益不断提升，生产效率快速提高，农民增收稳步提高。然反对者的意见不容忽视。实践中，确实存在难以逃避的法律风险，产生难以控制的社会保障问题：当农业合作社经营不善，破产将至，土地承包经营权是公司的登记资产，势必成为破产财产的一部分，破产清算让农民失去赖以生存的土地，生活保障难以为继。
(二)平等协商、自愿、有偿原则的落实障碍
土地承包经营权入股在法律规范中尽管并没有做详尽的规定，但各个地方的农村在土地改革中已经进行了很多尝试。如浙江省温岭市泽国镇牧南村土地股份合作公司，绍兴县王坛镇南岸村土地股份合作社，四川省成都市锦江区三圣乡红砂村土地承包经营权入股组成红砂花乡生态旅游管理公司等。在这些大胆探索中，有值得借鉴和推广的经验，也出现了很多让人担忧的问题。农村集体经济组织或乡镇府干预过多，强制村民以土地承包经营权入股乡镇农业企业现象时有发生。西南大学学生田某以四川省邛崃市，重庆市荣昌县、北碚区为调研样地，在 年7 月至 年1 月数月间，对三个研究区的1072 户农户分别进行问卷调查，收回有效问卷970 份，其中参与土地流转的问卷865 份，通过调查得出的结论之一是: 政府干预成为土地流转的最大促成因素。地方政府困于发展压力，追求政绩，只看企业入驻增加税收，在因土地补偿、租金、土地折股达不成一致时，强迫农民以土地承包经营入股。这样的做法不仅损坏政府形象，破坏干群关系，疏远党群关系，而且违背了《农村土地承包法》第三十三条“平等协商、自愿、有偿，任何组织和个人不得强迫或者阻碍承包方进行土地承包经营权流转”之规定。
(三)改变入股土地的农业用途时有发生
《中华人民共和国农村土地承包法》第三十三条规定土地承包经营权流转“不得改变土地所有权的性质和土地的农业用途”。作为全国城乡统筹综合配套改革试验区的重庆市在颁布的《服务重庆统筹城乡发展的实施意见》中表述到“在农村土地承包期限内和不改变土地用途的前提下，允许以农地承包经营权出资入股”。可见，无论是法律规定还是地方规章，都严令不得改变流转土地用途。但现实中，作为承租方的企业和专业合作社，对流转过来的土地并未全部作为农业生产和种植，而是在经济利益和资本运作中，改变或者变相的改变了入股流转土地的用途。
(四)土地入股经营失败后处置困难
流转土地缺乏总体规划，入股公司破产后后续利用难度大。对于偏远山村，地势不平，流转土地需要改造整治，使土地连片，易于公司进场开发。由于前期土地入股农业企业或者专业合作社难度较大，对于流转来的土地缺乏总体规划，以至于公司破产清算后，归还农民土地难以回归流转前的使用状态。

永久承包没有法律效力。