首先未办理产权证的商品房是可以起诉确权的。如果前期交易行为存在瑕疵，那么争议发生后及时主张权利，可以起到亡羊补牢的作用。但是，所有的诉讼都是有风险的，当事人需要在证据等方面上下足功夫，以加大胜诉的可能性。
在诉讼时，还需要需要注意以下两点：
1、发生纠纷先保全
购房人提起诉讼主张合同无效或对方违约要求退还房款，可以及时向法院申请诉讼保全，查封对方的房产，保障诉讼的顺利进行。
2、所购房屋被查封，异议及早提，权利早确定
目前楼市处于低迷期，开发商资金流转不畅，其作为被告的涉诉案件增多，法院会在诉讼及执行阶段对开发商的财产进行保全和执行，如果购房人未及时作出权属登记，其已付过房款的房屋往往会被法院查封，这种情况下，亡羊补牢的方式是，购房人应及时与作出查封的法院取得联系，提出异议，并且到有管辖权的法院提起确权诉讼，通过法律形式确认其合法权益。如果法院已经将房屋拍卖，执行完毕，则只能追究开发商违约或侵权的责任了。
法律依据：
《土地权属争议调查处理办法》第十四条
下列案件不作为争议案件受理：
(一)土地侵权案件;
(二)行政区域边界争议案件;
(三)土地违法案件;
(四)农村土地承包经营权争议案件;
(五)其他不作为土地权属争议的案件。