工程合同纠纷诉讼流程包括：
1、提起诉讼
就是与案件有利害关系的当事人向其认为有管辖权的法院提出诉讼请求。
2、准备答辩和请求
实际中，被告一旦向法院就起诉事项做了实质性答辩，就表示接受了法院的管辖权，日后就不得再以此法院无管辖权为由提出抗辩。
3、提证据保全程序
就是对于一切与案件有关的证据，若日后有灭失、湮没或难于使用之虞时，一方当事人可在起诉前或起诉后向法院提出申请，要求法院采取必要措施予以保全。
4、提供诉讼证据
凡是诉讼当事人想要证明他在诉讼中所主张的事实或要求，都必须首先提出证据予以证明，而证据包括人证、物证、书证、鉴定、勘验笔录等。
5、进行保全措施
为防止被告隐匿、变卖或转移财产，使原告日后得到胜诉时一无所获，使得法院判决无从强制执行，那么就要及时申请保全程序。
6、进行案件审理
按照选择的管辖的法院，确定具体的审理和答辩。
7、裁判和上诉
在法院作出第一审判决之后，要是有不服的，那么就可以及时去上诉了。
法律依据:
《中华人民共和国合同法》第二百七十八条、第二百八十条、第二百八十一条、第二百八十三条、第二百八十四条
《工资支付暂行规定》第十九条 劳动者与用人单位因工资支付发生劳动争议的，当事人可依法向劳动争议仲裁机关申请仲裁。对仲裁裁决不服的，可以向人民法院提起诉讼。