检察机关是对司法行为进行督察的司法机关，对公安机关的立案、法院的判决等司法行为可以行使监督的权利，这是三大司法机关相互制约的一种表现。
那么检察院立案后可以撤案吗?答案是肯定的。依据《刑事诉讼法》第十五条规定，有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪：
(一)情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的;
(二)犯罪已过追诉时效期限的;
(三)经特赦令免除刑罚的;
(四)依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的;
(五)犯罪嫌疑人、被告人死亡的;
(六)其他法律规定免予追究刑事责任的。
关于撤销案件的程序，根据立案单位的不同，有所区别。
一、如果是检察院立的案件。经审查如果符合法律的规定，属于可以不予追究刑事责任的案件，那么检察院是可以直接撤销。
二、如果是公安局立的案件，检察院可以通过向侦办公安机关提出建议撤销意见。最终由公安机关根据相关程序撤销案件。
法律依据：
《中华人民共和国刑事诉讼法》第十五条
有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪：
(一)情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的;
(二)犯罪已过追诉时效期限的;
(三)经特赦令免除刑罚的;
(四)依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的;
(五)犯罪嫌疑人、被告人死亡的;
(六)其他法律规定免予追究刑事责任的。