【解答】
根据《财政部、国家税务总局关于土地增值税若干问题的通知》(财税[2006]21号)文件第五条规定：“关于以房地产进行投资或联营的征免税问题，对于以土地(房地产)作价入股进行投资或联营的，凡所投资、联营的企业从事房地产开发的，或者房地产开发企业以其建造的商品房进行投资和联营的，均不适用《财政部、国家税务总局关于土地增值税一些具体问题规定的通知》(财税字[1995]048号)第一条暂免征收土地增值税的规定。”
股东已就投资宗地申报缴纳土地增值税，你公司应按评估值5亿元作为取得土地使用权的成本，在计算土地增值税时作为扣除项目处理。
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